Galileo Giornale di scienza e problemi globali

L'esperimento non si ripete

Se si vuole pubblicare uno studio di biologia molecolare su una delle maggiori riviste scientifiche - del calibro di “Nature”, “Science”, “The Lancet” - da due anni a questa parte è necessario condividere gli ingredienti e rivelare la ricetta: immettere cioè in un database pubblico i dati grezzi e le procedure che hanno portato ai risultati. Quindi, grazie a queste informazioni, tutti gli ultimi studi pubblicati sono virtualmente ripetibili. “Bene, proviamo”, si è detto John Ioannidis della School of Medicine dell’Università di Ioannina (Grecia) insieme a un gruppo internazionale di ricercatori: “Prendiamo 18 studi in uno dei campi più all'avanguardia della ricerca - lo studio dell’espressione genica tramite microarray - pubblicati tra il 2005 e il 2006 su “Nature Genetics”, e vediamo per quanti potremmo davvero ottenere gli stessi risultati”. Risposta: due. Degli altri, sei possono essere riprodotti solo in parte o con discrepanze, e dieci non sono riproducibili a causa della mancanza o dell’inesattezza dei dati. Galileo ha intervistato Cesare Furlanello, a capo del gruppo di ricerca “Modelli predittivi per la biomedicina e l’ambiente” della Fondazione Bruno Kessler, coautore, con Giuseppe Jurman, dell’indagine che è stata a sua volta pubblicata da “Nature Genetics”.

Dottor Furlanello, perché è importante mettere a disposizione della comunità scientifica dati grezzi e procedure?

“Per almeno tre motivi: primo, per essere validati i risultati devono poter essere riprodotti da altri laboratori; secondo, gli scienziati sono pur sempre esseri umani e soltanto in una situazione con completa documentazione posso scoprire se un’analisi è scorretta o addirittura se c’è stata frode; terzo, perché stiamo assistendo a un nuovo modo di fare scienza, connessa e incrementale, in cui un ricercatore può utilizzare i dati raccolti dai laboratori di tutto il mondo e aggiungerli ai suoi per arrivare a nuovi risultati. Negli Usa, i National Insititutes of Health sono obbligati a depositare i dati e la Uniform Guidelines of the International Committee of Medical Journal Editors chiede agli autori di descrivere la procedura seguita con sufficiente dettaglio da permettere agli altri di riprodurre il risultato. In molti casi, quindi, sono le stesse riviste o gli enti che finanziano gli studi che richiedono la condivisione piena delle informazioni sperimentali come condicio sine qua non per la pubblicazione dell’articolo”.

Cosa si intende per “scienza incrementale”?

“Da dieci anni a questa parte, oltre che sui risultati, la ricerca si fonda sempre più sulla possibilità di connettere dati grezzi: possiamo disporre di studi che coinvolgono migliaia di soggetti ed è recente la possibilità di accedere ai numeri di altri. E questo è tanto più importante in quelle discipline in cui la complessità dei metodi di analisi e la quantità dei dati aumentano in modo esponenziale, come negli studi di associazione che si basano sul genotipo e in generale nella genetica medica. Basti pensare che le prime analisi genetiche erano condotte su poche centinaia di geni, ora siamo arrivati a un milione di sonde che interrogano tutti i geni nelle loro varianti. La nuova generazione di ricercatori è cosciente del fatto che la conoscenza non sta nel singolo articolo, ma nella stratificazione e nell’accumulo delle informazioni”.

Condividere i dati conviene anche economicamente?

“Ovviamente sì, la produzione dei dati 'genomewide' è molto esosa: un’indagine su mille coppie casi/controllo può costare più di un milione di dollari. Da qui l’esigenza di centralizzare le informazioni, condividerle e farle verificare. In questo modo si può abbreviare il ciclo di produzione di un nuovo farmaco anche di 5-6 anni. Per questo credo che nel prossimo futuro le procedure per gestire e sintetizzare i dati saranno più importanti dei dati stessi, come dimostra il fatto che persino Google si era offerta di servire da database scientifico, con la messa online di software scientifici open source. Non è solo questione di soldi: la scienza procede anche per risultati negativi, ma le riviste tendono a pubblicare soltanto i risultati innovativi e positivi. Sono quindi esclusi, spesso, gli studi retrospettivi, che hanno come obiettivo quello di confermare i risultati di altre ricerche”.

Qual è la conseguenza di questo modo di procedere?

“Ci troviamo con una miriade di 'primi' risultati positivi, raramente validati, anche perché gli altri gruppi di ricerca non riescono a riprodurli. Proprio come ha confermato la nostra indagine. Dei 18 articoli considerati, 16 dichiaravano esplicitamente che i dati sperimentali del profilo di espressione genica erano pubblici: in 13 casi erano pubblicati sul database statunitense Geo (Gene Expression Omnibus) o sull’archivio europeo Ebi. Ma abbiamo dimostrato che questo non garantisce che siano davvero utilizzabili. Intanto per i ricercatori che seguono le regole c’è almeno una consolazione: dal nostro studio è emerso che chi segue gli standard di deposizione delle informazioni viene citato il doppio degli altri. Il campione è piccolo ma il dato è comunque indicativo e ci dice che una maggiore qualità della ricerca porta a una maggiore diffusione della scienza”.

Galileo Servizi Editoriali

• Giochi da primate NATIONAL GEOGRAPHIC KIDS

  close

  Giochi da primate

  I piccoli di scimpanzé giocano esattamente come i cuccioli di umani: fanno le lotte e si sfidano a ruba bandiera. E nessuno si fa mai male seriamente

  (continua a leggere su National Geographic Kids n.17)

  vai al sito galileoedit.it
• Quelli che il twist L'ESPRESSO

  close

  Quelli che il twist

  A Greifswald, in Germania, è stat completata la struttura base di Wendelstein 7-X: il reattore che potrebbe rappresentare il piano B nel caso in cui ITER - il più grande esperimento sulla fusione termonucleare in corso - dovesse deludere le aspettative

  (continua a leggere su L'Espresso n.5)

  vai al sito galileoedit.it
• Raccontare il tempo e i tempi della scienza FESTIVAL DELLE SCIENZE

  close

  Raccontare il tempo e i tempi della scienza

  Bruno Arpaia
  Francesco Cavalli Sforza
  Stefania Polvani
  
  Moderatore Elisa Manacorda, Galileo
  

  
  Il tempo è una sfida per la comunicazione scientifica. Rendere conto di questa complessa variabile nel racconto della scienza è un compito che i comunicatori sono chiamati a svolgere con chiarezza e rigore, senza mancare però di affascinare e coinvolgere il pubblico. Grazie alla partecipazione di esperti di comunicazione, l’incontro punterà l’attenzione sui diversi modi in cui è possibile parlare del tempo nella scienza, a partire da tre particolari aree di interesse così da offrire il più ampio scenario possibile: la fisica, con la teoria del Big Bang; l’evoluzione, con la storia del viaggio attraverso il tempo dell’essere umano; la medicina narrativa, che usa i tempi del racconto della malattia per migliorare la condizione del paziente.

  vai al sito galileoedit.it
• Tempo e stress FESTIVAL DELLE SCIENZE

  close

  Tempo e stress

  Lectio Magistralis di Ronald D. Siegel

  Introduce: Lorenzo Mannella, Galileo

  Lo “stress” è legato alle fantasie sul futuro: anche se in un dato momento proviamo un grande disagio, non ci sentiamo molto stressati a meno di non immaginare che il disagio si protrarrà nel tempo. Tre milioni di anni fa, i nostri antenati erano in competizione con altri animali selvatici nella savana africana. Essi sopravvissero perché ereditarono una risposta di “combattimento o fuga” che li aiutava ad affrontare l’emergenza con azioni tempestive in caso di minaccia, e perché svilupparono la capacità di pensare al passato, immaginare il futuro e pianificare azioni di conseguenza. Mentre questi sistemi, presi singolarmente, contribuivano in maniera efficace al miglioramento della sopravvivenza, operando insieme sono diventati una fonte di stress continuo. Fortunatamente molte culture umane hanno finito col trovare dei modi per allenare la mente a sospendere questa costante pianificazione della sopravvivenza, astrarsi dal flusso di pensieri e assaporare il momento presente. Questa conferenza esplorerà i modi in cui la scienza moderna sta adattando queste tecniche antiche per alleviare lo stress del mondo moderno.

  vai al sito galileoedit.it
• Botox nemico per la pelle L'ESPRESSO

  close

  Botox nemico per la pelle

  Blocca i muscoli. E spiana le rughe. Col rischio di paralisi e danni nervosi. E' il lato oscuro del superbusiness. Ma un'alternativa c'è

  E ancora

  Dinosauro da record

  (continua a leggere su L'Espresso n.4)

  vai al sito galileoedit.it
• La scienza fatta dal basso LINX MAGAZINE

  close

  La scienza fatta dal basso

  Dal videogioco per trovare la forma delle proteine a quello per classificare la morfologia delle galassie: con la citizen science, si gioca per contribuire alla ricerca.

  (continua a leggere qui)

  vai al sito galileoedit.it

Partners